Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFRP4Q6FHJ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms