Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREB3L3Q68CJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms