Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF187Q5TA31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF187Q5TA31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF187Q5TA31 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF187Q5TA31 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF187Q5TA31 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF187Q5TA31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF187Q5TA31 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms