Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRMPD1Q5SYB0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRMPD1Q5SYB0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms