Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAP1Q5SW96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms