Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTC39AQ5SRH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 477 ms