Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITRM1Q5JRX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITRM1Q5JRX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITRM1Q5JRX3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms