Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB6CQ53S08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms