Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL12Q53G59 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL12Q53G59 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms