Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A4Q4VNC1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms