Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01620Q4KN68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms