Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms