Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP5B1Q2VPB7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP5B1Q2VPB7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms