Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C15orf59Q2T9L4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C15orf59Q2T9L4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms