Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRED3Q2MJR0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRED3Q2MJR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms