Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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