Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMN1Q16637 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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