Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSX1Q16384 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SSX1Q16384 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SSX1Q16384 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SSX1Q16384 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SSX1Q16384 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SSX1Q16384 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX1Q16384 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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