Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC6Q16204 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms