Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1Q15904 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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