Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USF2Q15853 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USF2Q15853 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USF2Q15853 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USF2Q15853 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USF2Q15853 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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