Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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