Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIP11Q15643 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIP11Q15643 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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