Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC23BQ15437 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms