Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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