Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDCD1Q15116 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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