Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC3Q15034 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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