Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NWD1Q149M9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NWD1Q149M9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
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