Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB39AQ14964 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39AQ14964 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms