Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB1Q14722 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB1Q14722 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms