Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IHHQ14623 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IHHQ14623 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IHHQ14623 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IHHQ14623 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IHHQ14623 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IHHQ14623 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IHHQ14623 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IHHQ14623 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IHHQ14623 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IHHQ14623 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IHHQ14623 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IHHQ14623 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IHHQ14623 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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