Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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