Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX39BQ13838 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX39BQ13838 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX39BQ13838 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX39BQ13838 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX39BQ13838 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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