Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL2Q13617 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL2Q13617 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms