Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TOP3AQ13472 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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