Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms