Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IKZF1Q13422 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IKZF1Q13422 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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