Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P3Q13401 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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