Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H3Q13133 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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