Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4Q12950 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXD4Q12950 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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