Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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