Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBRQ0VD83 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBRQ0VD83 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms