Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP3CAQ08209 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms