Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REG3AQ06141 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REG3AQ06141 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REG3AQ06141 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REG3AQ06141 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REG3AQ06141 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REG3AQ06141 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms