Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN1Q04323 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms