Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRB3Q04118 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms