Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms