Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MUC3AQ02505 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms