Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALDH6A1Q02252 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH6A1Q02252 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms