Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELBQ01201 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RELBQ01201 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RELBQ01201 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RELBQ01201 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms